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Pesquisa : GENOTIPO [Descritor de assunto]
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Id:7049
Autor:Ferreira, Isabelle Martins Ribeiro
Título:Genotipagem de isolados de Toxoplasma gondii em pacientes com Aids e toxoplasmose cerebral Genotyping of Toxoplasma gondii isolates form patients with Aids and cerebral toxoplasmosis-
Fonte:São Paulo; s.n; 2008. 94 p. ilus, tab, graf.
Tese:Apresentada a São Paulo(Estado) Secretaria da Saúde. Coordenadoria de Controle de Doenças. Programa de Pós-Graduação em Ciências para obtenção do grau de Mestre.
Resumo:Este estudo investigou as características genotípicas de isolados de 87 pacientes com toxoplasmose cerebral e AIDS tratados no Instituto de Infectologia Emílio Ribas -São Paulo. O diagnóstico laboratorial da toxoplasmose cerebral foi baseado na sorologia e PCR positivas realizadas em amostras de sangue e/ou líquido cefalorraquidiano. As genotipagens foram realizadas utilizando-se quatro marcadores (5’- SAG2, 3’- SAG2,SAG3 e GRA6). Cada um dos marcadores distingue as três linhagens clonais de Toxoplasma gondii designadas como tipos I, II e III, tratando-se os produtos de PCR amplificados com enzimas de restrição (PCR-RFLP). Foram obtidos os seguintes resultados: 40 pacientes (46%) foram infectados com cepas do tipo I; 4 (4%) com as do tipo III; 13 (15%), com cepas polimórficas (genótipos incomuns); 6 pacientes com cepas do tipo I ou II; e 15 (17%) dos pacientes foram infectados com cepas incapazes de serem genotipadas pelos marcadores utilizados. A PCR-RFLP também identificou 9 (11%) isolados clínicos como sendo do tipo II, genótipo ainda não descrito na América do Sul. Contudo, o sequênciamento dos produtos gerados na “nested”-PCR de uma amostra classificada como tipo II (marcador SAG3) e de isolados polimórficos (marcadores 5’-SAG2, SAG3 e GRA6) mostrou diferenças nucleotídicas quando comparadas com as cepas clonais dos tipos I, II e III. Estes dados confirmam estudos prévios realizados na América do Sul demonstrando que cepas de T.gondii prevalentes no Brasil são altamente polimórficas. (AU).
Descritores:Genótipo
Toxoplasma
Reação em Cadeia da Polimerase
Polimorfismo de Fragmento de Restrição
Síndrome de Imunodeficiência Adquirida
Toxoplasmose Cerebral
Meio Eletrônico:http://ses.sp.homolog.bvs.br/lildbi-textos/docsonl...
Localização:BR1310.1; Formato eletrônico


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Id:6083
Autor:Kalmar, Erika Maria do Nascimento
Título:Avaliação da resistência do HIV-1 às drogas anti-retrovirais em 150 pacientes em interrupção terapêutica por mais de seis meses Evaluation of the resistance of the HIV-1 to the antiretroviral drugs in 150 patients in therapeutical interruption for more than six months-
Fonte:São Paulo; s.n; 2007. 84 p. tab, graf.
Tese:Apresentada a Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina para obtenção do grau de Doutor.
Resumo:INTRODUÇÃO: A mudança nos critérios de introdução das drogas anti-retrovirais, assim como a dificuldade na manutenção da terapia anti-retroviral de alta eficácia, tem levado à descontinuação da terapêutica por longo período de tempo em alguns pacientes infectados pelo vírus da imunodeficiência humana adquirida-tipo 1 (HIV-1). O objetivo deste estudo foi a caracterização dos fatores que levam à interrupção terapêutica e a avaliação da persistência da resistência aos anti-retrovirais após a interrupção da terapia anti-retroviral. MÉTODOS: Foram incluídos na pesquisa 150 pacientes de dois serviços de atendimento ambulatorial de atenção a pacientes infectados pelo HIV-1 da cidade de São Paulo, os quais se achavam em interrupção terapêutica havia pelo menos 6 meses. Os pacientes foram submetidos a um questionário e houve consulta aos prontuários. foi realizada coleta de amostra de sangue para teste de genotipagem. O DNA pró-viral foi amplificado e seqüenciado para a região da protease e transcriptase reversa do vírus. As seqüências foram analisadas por meio do algoritmo de Stanford, sendo consideradas resistentes as amostras com resultado parcial ou completo de resistência a pelo menos uma droga. RESULTADOS: Dos 150 pacientes, 137 tiveram DNA do HIV-1 amplificado e sequenciado, sendo que 38 apresentaram cepas resistentes. Entre os 38 pacientes com resistência, 29 apresentavam mutações para os análogos nucleosídios inibidores da transcriptase reversa, 15 para os não análogos nucleosídeos inibidores da transcriptase reversa, e 5 para os inibidores da protease. A detectabilidade da carga viral antes da interrupção terapêutica foi o único fator associado com a resistência do vírus. Cento e dez pacientes suspenderam a medicação por orientação médica. A principal causa das interrupções terapêuticas foram os efeitos adversos para 58, seguida de 45 pacientes fora dos critérios atuais de início da terapia e/ou boas condições clínico/laboratoriais, e baixa adesão em 30. No ano anterior à pesquisa, 56 pacientes relataram relação sexual desprotegida e 130 mais que 2 parceiros. CONCLUSÕES: A frequência de mutações de resistência revelou-se alta nesse grupo de pacientes. Tais mudanças parecem ter um fitness semelhante ao das cepas selvagens, pois mesmo sem a pressão seletiva do medicamento por mais de 6 meses, mantiveram-se como cepas majoritárias...(AU).
Descritores:HIV-1
Anti-Retrovirais
Genótipo
Resistência Viral a Drogas
Anti-Retrovirais/ef adv
Localização:BR1310.1; T0322


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Id:5278
Autor:Cavalheiro, Norma de Paula
Título:Hepatite C: transmissão entre casais ..-
Fonte:São Paulo; s.n; 2004. [1] p. ilus, tab, graf.
Descritores:Hepatite C Crônica/virol
Transmissão Horizontal de Doença
Parceiros Sexuais
Hepatite C Crônica/epidemiol
 Questionários
 Fatores de Risco
 Análise de Sequência com Séries de Oligonucleotídeos/métodos
 Genótipo
 Filogenia
Limites:Masculino
Feminino
Humano
Localização:BR1310.1; CD087


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Id:3344
Autor:Viso, Ana T Rodriguez; Oliveira, Augusto C. Penalva de; Boas, Lucy S Vilas.
Título:Cytomegalovirus Glycoprotein B Genotypes and Central Nervous System Disease in AIDS Patients.
Fonte:J Med Virol;71(3):404-407, Nov. 2003. tab.
Resumo:To investigate any association between cytomegalovirus glycoprotein B (CMV gB) subtypes and central nervous system (CNS) disease in AIDS patients, proportions of different gB genotypes detected in AIDS patients with CNS disease were compared with the gB genotypes detected in AIDS patients with no neurological disorder. The patients were matched by CD4+ cell counts. CMV was detected by PCR in cerebrospinal fluid (CSF) samples obtained from AIDS patients with CNS disease and from urine and saliva samples obtained from AIDS patients without CNS disease. CMV strains obtained were digested by restriction enzymes HinffI and RsaI to classify the genotypes. The CMV gB genotype was determined in 26 CSF samples. Of these, 11/26 (42.3 por cento) typed as gB group 1, seven (26.9 por cento) as gB2, four (15.4 por cento) as gB3, and four (15.4 por cento) as gB4. The CMV gB genotype frequency distribution in the 42 AIDS patients without CNS disease showed that 18/42 (42.8 por cento) were classified as gB group 1, 10 (23.8 por cento) as gB2, seven (16.6 por cento) as gB3, and seven (16.6 por cento) as gB4. In the present study, no association was found between CMV gB genotypes and CMV-related central nervous system disease.
Descritores:Infecções Oportunistas Relacionadas com a AIDS/fisiopatol
Infecções Oportunistas Relacionadas com a AIDS/virol
Contagem de Linfócito CD4
Infecções do Sistema Nervoso Central/fisiopatol
Infecções do Sistema Nervoso Central/virol
Citomegalovirus/clas
Citomegalovirus/genet
Citomegalovirus/isol
Citomegalovirus/patogen
DNA Viral/lcr
Genótipo
Infecções por HIV/compl
Infecções por HIV/virol
Reação em Cadeia da Polimerase
Proteína de Invólucro Viral/genet
Limites:Humano
Meio Eletrônico:http://www3.crt.saude.sp.gov.br/arquivos/arquivos_...
Localização:BR1310.1; Formato Eletrônico


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Id:2778
Autor:Cavalheiro; Norma; Norma de Paula Cavalheiro
Título:Hepatite C: transmissao entre casais ..-
Fonte:Sao Paulo; s.n; 2004. 112 p. ilus, tab.
Tese:Apresentada a Faculdade de Medicina da Universidade de Sao Paulo para obtenção do grau de Doutor.
Resumo:Introducao: a ocorrencia e eficiencia da transmissao sexual do VHC na ausencia de outros fatores de risco ainda e muito controversa. Foram investigados e analisados 24 casais, ambos conjuges infectados com VHC. Destes, 22 apresentaram o mesmo subtipo viral e a anlise filogenetica de parte da regiao NS5b mostrou altos indices de homologia nas sequencias entre os virus dos casais infectados. objetivo: analise da transmissao da hepatite c entre casais heterossexuais. Metodo: o estudo recrutou 45 casais. Destes, 24 foram selecionados e incluidos na pesquisa, com diagnostico clinico e laboratorial para a hepatite c cronica. a infeccao foi diagnosticada por testes imunoenzimaticos de terceira geracao e pela presenca da particula viral circulante detectada pela PCR. As amostras de sangue foram coletadas entre os anos de 1999 e 2002. Foram sequenciadas partes das regioes 5NC e NS5b do VHC, para determinacao dos subtipos virais. Os testes utilizados para as PCRs estao disponiveis para pesquisa e foram respectivamente TRUGENE 5 NC test e Titan one Tube RT-PCR Kits. para as PCRs dos sequenciamentos foi utilizado o kit CLIP sequencing test. As sequencias foram analisadas com o sistema de sequenciamento Open Gene DNA , software na versao 3.1, biblioteca especifica. para o alinhamento das sequencias, referentes a regiao NS5b, foi utilizado o programa Clustal W e a arvore filogenetica foi gerada pelo metodo Neighbor Joining..
Descritores:Questionarios
Entrevistas
Filogenia
Genotipo
Oligonucleotidios
Fatores de risco
Parceiros sexuais
Transmissao horizontal
Epidemiologia
Virologia
Hepatite c
Tese
Limites:HUMANO
Localização:T0272; BR1310.1


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Id:2417
Autor:ROCHE; *.EUROPEAN ASSOCIATION FOR THE STUDY OF THE LIVER (EASL)2003*.
Título:SEEKING THE CHANCE FOR A CURE IN CHRONIC HEPATITISA SYMPOSIUM HELD IN CONJUNCTION WITH THE38TH ANNUAL MEETING OF THE ..-
Fonte:s.l; s.n; July.2003. 01 p. ilus.
Descritores:IMPLICA€OES
GENOTIPO 2
GENOTIPO 1/HVL
COPEGUS
PEGASYS
MEDICAMENTO
GENOTIPO 4
HCV
TRATAMENTO
TERAPIA
VIRUS
INFEC€AO
hepatite C
simposio
cura
hepatite cronica
HIV
CD-ROM
Localização:CD034; BR1310.1



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